Table 1 Primers used for nested-PCR assay
Primers | Sequences | |
|---|---|---|
NS5A 1a | F1 | 5-TACGTGCCGGAGAGCGATG-3 |
| Â | R1 | 5-AAGTTGCCTTGAGAGATGGAGC-3 |
| Â | F2 | 5-CCTCACTGTRACCCAGCTCC-3 |
| Â | R2 | 5-AGGAGCTGGCCACAGAAGG -3 |
NS5A 3a | F1 | 5-CACCGACGCACTATGTTCC-3 |
| Â | R1 | 5-CAAGTGGCCTTCAACGACG-3 |
| Â | F2 | 5-GAGGGTCACTGCATTGCTG-3 |
| Â | R2 | 5-AGTTGGCTGGCGGATGAG-3 |
NS5B 1a | F1 | 5-TGGCCATCAAGTCCCTCAC-3 |
| Â | R1 | 5-CGCTATTGGAGTGAGTTTGAG-3 |
| Â | F2 | 5-GGCCCTCTTACCAATTCAAG-3 |
| Â | R2 | 5-TGAAGAGGTACTTGCCACATATG-3 |
NS5B 3a | F1 | 5-GAAGAGGAGATATACCAATGCTG-3 |
| Â | R1 | 5-CGTGACACGCTGTGATAAATG-3 |
| Â | F2 | 5-ACGGAGCGGCTTTACTGC-3 |
| Â | R2 | 5-CGTACCGCCCAATTAAAGAG-3 |