Skip to main content

Table 3 The correlations of MKI67 with immune cell gene markers for LIHC by GEPIA2

From: Correlation of MKI67 with prognosis, immune infiltration, and T cell exhaustion in hepatocellular carcinoma

Immune cell Gene markers Tumor Tumor-sum Normal Tumor-sum
Cor P value Cor P value Cor P value Cor P value
CD8+ T cell CD8A 0.2 ** 0.2 ** 0.39 * 0.37 *
  CD8B 0.23 ***    0.31 0.026   
T cell CD6 0.12 0.024 0.2 ** 0.24 0.093 0.41 *
  CD3D 0.23 ***    0.42 *   
  CD3E 0.13 *    0.34 0.017   
  SH2D1A 0.13 0.014    0.39 *   
  TRAT1 0.049 0.35    0.36 *   
  CD3G 0.24 ***    0.35 0.013   
  CD2 0.15 *    0.3 0.035   
B cell CD19 0.096 0.066 0.17 * 0.28 0.051 0.44 *
  FCRL2 0.068 0.19    0.5 **   
  KIAA0125 0.052 0.32    0.52 **   
  TNFRSF17 0.06 0.25    0.43 *   
  SPIB 0.13 0.01    0.22 0.12   
  PNOC 0.071 0.18    0.48 **   
  CD79A 0.062 0.24    0.38 *   
Monocyte CD86 0.32 *** 0.28 *** 0.21 0.15 0.28 0.052
  CD115(CSF1R) 0.25 ***    0.27 0.056   
TAM CD68 0.26 *** 0.27 *** 0.2 0.15 0.21 0.14
  IL10 0.21 ***    0.15 0.29   
M1 Macrophage IRF5 0.31 *** 0.31 *** 0.13 0.37 0.07 0.63
  COX2(PTGS2) 0.078 0.14    − 0.032 0.82   
M2 Macrophage CD163 0.15 * 0.12 0.018 0.18 0.22 0.25 0.078
  MS4A4A 0.16 *    0.22 0.12   
Neutrophils FPR1 0.25 *** 0.37 *** − 0.035 0.81 0.15 0.3
  SIGLEC5 0.31 ***    − 0.011 0.94   
  CSF3R 0.22 ***    0.11 0.43   
  FCGR3B 0.05 0.34    0.17 0.24   
  CEACAM3 0.19 **    0.064 0.66   
  CD116(ITGAM) 0.33 ***    0.36 0.011   
CD8+ T cell CD8A 0.2 ** 0.2 ** 0.39 * 0.37 *
  CD8B 0.23 ***    0.31 0.026   
T cell CD6 0.12 0.024 0.2 ** 0.24 0.093 0.41 *
  CD3D 0.23 ***    0.42 *   
  CD3E 0.13 *    0.34 0.017   
  SH2D1A 0.13 0.014    0.39 *   
  TRAT1 0.049 0.35    0.36 *   
  CD3G 0.24 ***    0.35 0.013   
  CD2 0.15 *    0.3 0.035   
B cell CD19 0.096 0.066 0.17 * 0.28 0.051 0.44 *
  FCRL2 0.068 0.19    0.5 **   
  KIAA0125 0.052 0.32    0.52 **   
  TNFRSF17 0.06 0.25    0.43 *   
  SPIB 0.13 0.01    0.22 0.12   
  PNOC 0.071 0.18    0.48 **   
  CD79A 0.062 0.24    0.38 *   
Monocyte CD86 0.32 *** 0.28 *** 0.21 0.15 0.28 0.052
  CD115(CSF1R) 0.25 ***    0.27 0.056   
TAM CD68 0.26 *** 0.27 *** 0.2 0.15 0.21 0.14
  IL10 0.21 ***    0.15 0.29   
M1 Macrophage IRF5 0.31 *** 0.31 *** 0.13 0.37 0.07 0.63
  COX2(PTGS2) 0.078 0.14    − 0.032 0.82   
M2 Macrophage CD163 0.15 * 0.12 0.018 0.18 0.22 0.25 0.078
  MS4A4A 0.16 *    0.22 0.12   
Neutrophils FPR1 0.25 *** 0.37 *** − 0.035 0.81 0.15 0.3
  SIGLEC5 0.31 ***    − 0.011 0.94   
  CSF3R 0.22 ***    0.11 0.43   
  FCGR3B 0.05 0.34    0.17 0.24   
  CEACAM3 0.19 **    0.064 0.66   
  CD116(ITGAM) 0.33 ***    0.36 0.011   
Central memory T cell CCR7 0.063 0.23 0.12 0.023 0.37 * 0.38 *
  SELL 0.1 0.055    0.24 0.092   
  IL7R 0.042 0.43    0.31 0.031   
Resident memory T cell CD69 0.063 0.23 0.28 *** 0.3 0.037 0.25 0.075
  ITGAE 0.21 ***    − 0.046 0.75   
  CXCR6 0.12 0.02    0.25 0.085   
  MYADM 0.27 ***    − 0.092 0.52   
Exhausted T cell TIM-3(HAVCR2) 0.14 * 0.3 *** 0.15 0.31 0.37 *
  PD-1 (PDCD1) 0.15 *    0.46 **   
  TIGIT 0.21 ***    0.34 0.015   
  LAG3 0.16 *    0.15 0.31   
  CXCL13 0.085 0.1    0.28 0.049   
  LAYN 0.12 0.024    0.26 0.073   
Resting Treg T cell FOXP3 0.011 0.84 0.18 ** 0.29 0.038 0.47 **
  IL2RA 0.2 ***    0.18 0.21   
Effector Treg T cell CTLA4 0.21 *** 0.27 *** 0.36 * 0.4 *
  CCR8 0.23 ***    0.37 *   
  TNFRSF9 0.018 0.74    0.36 *   
  1. Cor, ρ value of Spearman's correlation. Tumor, single gene marker correlation analysis in LIHC tissue. Normal, single gene marker correlation analysis in normal tissue; Cor, ρ-value upon Spearman correlation. Significance levels: *P < 0.05; **P < 0.01; ***P < 0.001
Back to article page

BMC Gastroenterology

ISSN: 1471-230X

Contact us